热点关注:  
放射性同位素 粒子加速器 辐照杀菌 无损检测 高新核材 辐射成像 放射诊疗 辐射育种 食品辐照保鲜 废水辐照 X射线 中广核技 中国同辐

首次大规模分析癌症基因组中的重复扩增,有望揭示治疗靶点

2022-12-19 18:37     来源:生物通     放射诊疗靶向治疗
来自斯坦福大学、哥伦比亚大学、纽约基因组中心等机构的研究人员近日鉴定出多种癌症类型中的体细胞串联重复扩增。其中,一种肾癌中的重复扩增有望成为治疗靶点。这项成果于12月14日发表在《Nature》杂志上。

斯坦福大学医学院遗传学系主任 Michael Snyder 教授是论文的通讯作者之一。他及其同事在文中写道:“我们的研究结果揭示了癌症基因组中一种探索不多的遗传改变,具有重要的研究和治疗意义。”他们指出,“据我们所知,这是首次对神经系统疾病以外的重复扩增进行全基因组范围的调查。”

研究人员对2,500多名患者的2,622个肿瘤样本进行了基因组分析,这些患者来自国际癌症基因组联盟和癌症基因组图谱计划,覆盖29种癌症类型。他们采用了ExpansionHunter Denovo生物信息学工具以及基于读取深度的过滤和其他分析,在7种癌症类型中发现了160种反复出现的重复扩增(rRE)。

研究人员注意到,除了5种rRE外,其他重复扩增似乎都是癌症亚型特有的,出现在前列腺癌、肝癌、脑癌、卵巢癌、肾癌和肺癌的不同亚型中。许多重复扩增位于基因调控序列内或周围,特别是癌症体细胞突变目录数据库(COSMIC)中的基因。

例如,他们特别关注了肾细胞癌中UGT2B7基因调控元件中的GAAA重复扩增,这段扩增已经过长读长测序和PCR验证。在分析后,他们发现超过三分之一的肾癌患者体内都有这种反复出现的重复扩增。

考虑到弗里德赖希共济失调(Friedreich's ataxia)这种神经系统疾病与FXN基因内的GAA 三核苷酸重复有关,而一种名为Syn-TEF1的小分子能够跨过GAA重复进行转录,研究人员推测,类似的策略在肾癌治疗上也许是可行的。

在随后的细胞系实验中,研究人员发现在含有GAAA重复扩增的肾细胞癌中,靶向GAAA分子的Syn-TEF3能够以剂量依赖性的方式抑制细胞增殖。

“最戏剧性的结果是,你可以真正地靶向它们,并阻止细胞增殖,” Snyder说,并认为“从发现一下子跳到了治疗,这是相当不寻常的”。

研究人员认为,从目前的结果来看,类似的分析有可能从其他癌症类型中找到可成为靶点的重复扩增。一些并非癌症的疾病也有望受益于此方法。

“到目前为止,神经退行性疾病中的重复扩增被研究得最多,但重复扩增的研究不应限于此,”他们表示。“许多疾病目前都有数千个高质量的全基因组序列,而我们的结果为分析癌症等复杂疾病的WGS数据集提供了一个框架。”


推荐阅读

PSMA PET/MRI准确预测前列腺癌复发风险

加利福尼亚州斯坦福大学医学中心核医学和分子成像部主任、放射学教授Andrei Iagaru医学博士表示:“临床医生目前使用活检结果和临床信息,如前列腺特异性抗原(PSA)水平,来预测前列腺癌是否生长缓慢,或是否会迅速扩散,需要积极治疗。然而,功能成像,如PET/MRI,越来越多地被认为是一种识别有持续或复发疾病风险的患者的方法。” 2023-01-08

Fusion Pharmaceuticals和BWXT Medical宣布合作开发锕-225,以扩大开发靶向α疗法的供应

锕-225是一种用于靶向α疗法(TAT)的α放射同位素,该疗法将同位素与特定的肿瘤寻找靶向载体结合,以杀死癌细胞,同时将对健康组织的影响降至最低。对同位素的需求日益增长,但目前能够生产大量高纯度锕的供应商数量有限。 2023-01-07

雄安宣武医院建设现场:优化工艺建好医疗建筑

直线加速器和回旋加速器是医疗行业关于肿瘤诊疗的重要设备,因其使用时会产生辐射,用于这类设备房间的混凝土墙体和顶板的厚度都远大于普通建筑,施工过程如何控制结构质量,都是项目团队要重点学习和了解的。 2023-01-06

钟鹤立:肿瘤放射治疗实践中的射线装置与技术发展

本视频为深圳市人民医院放疗科副主任、物理师主任钟鹤立,在中国核能高质量发展大会暨深圳核电产业博览会(深圳核博会),核技术产业论坛上发表题为《肿瘤放射治疗实践中的射线装置与技术发展》的演说录像。 2023-01-04

两篇文章开启随心所欲定向减肥:首款选择性靶向内脏脂肪的纳米药物

这个研究团队,由CUIMC病理学和细胞生物学副教授Li Qiang和生物医学工程和系统生物学教授Kam Leong领导,Kam Leong是使用多极化清除病原体的先驱。研究人员发现,脂肪组织中含有大量的带负电荷的细胞外基质(ECM)来固定脂肪细胞。他们认为这种带负电荷的ECM网络可能为带正电荷的分子提供某种高速公路系统。 2023-01-03

阅读排行榜