瑞金医院的质子治疗系统已报经国家医疗保障局同意，目前收费标准为：同一适应证每疗程最高不超过17万元。
2014年12月，瑞金医院质子中心项目正式开工;2017年6月，基建竣工;2021年8月，临床试验启动招募;2022年6月3日完成上市前临床试验，全部受试者的3个月随访结果证明，肿瘤局控率达到100%，前列腺癌患者无生化复发率达100%。未发生3级及以上急性毒性反应。配置1个眼束线治疗室，1个固定束治疗室，1个180°旋转机架治疗室，以及1个360°旋转机架治疗室。其中，固定束治疗系统、180°旋转束治疗系统于2022年9月26日正式获得国家药监局颁发的《中华人民共和国医疗器械注册证》。
